在國際上被證明是有效的制度或政策，并不意味著在國內(nèi)就一定會成功。“問題的關(guān)鍵在于不能一賣了之。”清華大學長三角研究院副院長陳呂軍指出，“政府必須做到‘取之于污用之于污’。”出售排污權(quán)，如果僅僅停留在企業(yè)與政府之間“出錢與收錢”的層面，也就等價于“企業(yè)有錢就可直接排污”和“政府以犧牲環(huán)境換金錢”，這顯然是跟政策制定的初衷相違背的。

　　九三學社社員郭進說，1999年我國引入排污權(quán)交易，已在區(qū)域內(nèi)取得了極大成功。但從現(xiàn)實情況來看，這一制度的推行還面臨著很多問題。

　　由于信息的不對稱及其不斷變化，政府相關(guān)機構(gòu)很難根據(jù)所掌握的現(xiàn)有資料確定各污染企業(yè)的實際排污情況，所以也就難以有效地在各污染企業(yè)間分配排污許可。一旦分配結(jié)束，這種格局將在較長時期內(nèi)保持相對固定，缺乏應有的靈活性。這正是我國現(xiàn)行排污許可證制度的弊端。

　　從目前嘉興初步的實踐看，嘉興環(huán)保局翁建榮局長認為，還存在一些問題有待解決。如政策、法律依據(jù)滯后。對開展排污權(quán)交易在法律法規(guī)上還存在著一些空白，缺少強有力的支撐。同時，排污權(quán)交易的社會信用體系尚未建立、執(zhí)法機制也存在缺失。交易制度不夠完善。要建立一個成熟的排污權(quán)交易市場，必須要有相應的交易制度與其配套。交易市場剛剛起步，對如何制訂滿足總量控制的可轉(zhuǎn)讓的排污許可證制度；在價格機制上如何更多地引入市場經(jīng)濟的規(guī)則，實現(xiàn)環(huán)境保護社會成本最小化的目標也值得探索。同時，在交易規(guī)程上，如何科學確認污染物超額削減量和許可證購買對象，如何避免成交后違反交易合同、非法進行排污交易，超出許可證范圍排放污染物等。

　　一些環(huán)保專業(yè)人士和基層干部認為，嘉興市目前實行的排污權(quán)交易要警惕兩種風險。

　　一是“劣幣驅(qū)逐良幣”的市場風險。由于排污權(quán)交易僅在浙江嘉興地區(qū)試行，這個區(qū)域內(nèi)新建的排污企業(yè)需要花巨資購買排污權(quán)，會導致企業(yè)經(jīng)營成本上升，在同沒有實行排污權(quán)交易的周邊地區(qū)的企業(yè)競爭時，處于“成本劣勢”，帶來客觀上的不公平競爭。

　　二是廉政風險。環(huán)保等政府部門事實上掌握著排污權(quán)的分配指標和交易價格，一旦權(quán)力參與排污資源分配，會導致又一種權(quán)力尋租。在沒有建立科學、公開、公平、公正的排污權(quán)初始分配機制和定價機制之前，廉政風險會逐漸放大。